试管婴儿囊胚移植提供更为生理性的生存环境。因为囊胚替代了早期卵裂及未卵裂胚胎进行移植，能让移植胚胎得到更好的环境来成长。胚胎的发育和子宫内膜得到同步，使胚胎种植率、临床妊娠率提高，同时还能够降低多胎妊娠率，更符合生理着床时间。

　　试管婴儿囊胚移植使胚胎移植具有选择性。体外培养第2天至第3天一般会有发育阻滞，而囊胚培养则能够克服这个问题，筛选出质量良好、可供移植的胚胎。用囊胚移植，能够缩短种植于胚胎继续发育之间的时间。从而降低不良因素的影响。